紫外交聯儀的主要用途為在膜上交聯核酸，其是一種254mm紫外輻射系統，其有很多用途，UV滅菌消除PCR污染、嘧啶二聚體產生的部分限制性內切酶消化、RecA突變篩選以及瓊脂糖凝膠中DNA的切割等亦是其用途。其的應用價值也體現在聚合物紫外處理和紫外滅菌等方面。以下為紫外交聯實驗原理和步驟。
紫外交聯儀的使用步驟：
1、混合10μL含有高親和性蛋白結合位點的目的序列的單鏈M13載體和等摩爾的17 bp M13通用引物，使用1×限制性內切核酸酶緩沖液調節終體積到100μL。在90攝氏度下加熱5分鐘。在室溫下冷卻、
2、在雜交混合物中加入Klenow酶5μL、水7μL、10×限制性內切核酸酶緩沖液7.5μL、0.1 mol/L二硫蘇糖醇1.75μL、50×dNTP/BrdU溶液3.5μL、[α32P]dCTP50μ等反應物，在16攝氏度下溫浴90分鐘。
3、在68攝氏度下加熱10分鐘，將Klenow酶滅活。
4、使用40U限制性內切核酸酶在合適條件下消化，使得20600 bp的DNA片段產生。
5、將乙酸銨添加到0.3 mol/L，DNA使用2倍體積的1**%乙醇進行沉淀，在TE緩沖液中重懸。
6、電泳在含有0.5μg/mL溴化乙錠的瓊脂糖凝膠上進行。所要的DNA片段使用DEAE膜進行分離。
7、BrdU取代的DNA片段的特異活性使用閃爍計數器進行檢測，DNA的濃度的估計采用溴化乙錠點跡定量法。能夠采用遷移率變動DNA結合分析法來檢測探針的完整性和功能。
8、將下列結合反應建立于1.5 mL圓底小瓶中：將10-20μg DNA載體、經緩沖的含有結合蛋白的提取液以及105cpm均衡標記的探針混合，調節總體積到50μL。瓶口使用塑料薄膜封住，固定再采用Parafilm膜加封。
9、在試管架上放上小瓶，于正上方5厘米處使用倒置的紫外透射燈照射1個小時。
10、將1U微球菌核酸酶、DNA酶I 4μg、0.5 mol/L CaCl2 1μL等反應物加入到各結合反應管中，在37攝氏度下消化半個小時。
11、在反應混合物中加入等體積的2×SDS樣品緩沖液，在100攝氏度中煮沸5分鐘。
12、樣品的電泳在適當濃度的不連續SDS-聚丙烯酰胺凝膠上進行。
13、完成電泳之后，將凝膠前沿的染料切去。
14、干膠，使用增感屏放射自顯影13日，來對交聯的蛋白質進行觀測。
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